Pengurus Bagian Anatomi, Embriologi, dan Antropologi Fakultas Kedokteran Universitas Gadjah Mada yang pertama adalah Prof. Drs. Radiopoetro yang ditunjuk oleh Pimpinan Universitas Gadjah Mada sebagai Kepala Bagian.
Susunan pengurus Bagian Anatomi, Embriologi, dan Antropologi Fakultas Kedokteran pada periode-periode berikutnya adalah sebagai berikut:
Tahun 1946 – 1966
- Kepala Bagian: Prof. Drs. Radiopoetro
Tahun 1967 – 1972
- Kepala Bagian: dr. Baghowi Bachar
Tahun 1980 – 1987
- Kepala Bagian: Prof. dr. Soemijati Ahmad
Tahun 1988 – 1991
- Prof. Dr. Soebijanto
Tahun 1992 – 1999
- Kepala Bagian: Prof. dr. Soedjono Aswin, Ph.D
Tahun 2001 – 2005
- Kepala Bagian: Dr. dr. Djoko Prakosa, PA(K)
Tahun 2006 – 2007
- Kepala Bagian: dr. Muhammad Mansyur Romi, SU.,PA(K)
- Sekretaris Bagian: dr. Dwi Cahyani Ratna Sari, M.Kes.,PA(K)
Tahun 2008 – 2009
- Kepala Bagian: dr. Dwi Cahyani Ratna Sari, M.Kes.,PA(K)
Tahun 2009 – 2013
- Kepala Bagian: dr. Dwi Cahyani Ratna Sari, M.Kes.,PA(K)
- Sekretaris Bagian: dr. Santosa Budiharjo, M.Kes.,PA(K)
Tahun 2014 – 2018
- Kepala Bagian: dr. Muhammad Mansyur Romi, SU.,PA(K)
- Sekretaris Bagian: dr. Santosa Budiharjo, M.Kes.,PA(K)